O outrora frutífero e glorioso reino de Q'markaj foi derrubado pelas trevas. Influenciou todos os cinco mortais poderosos do reino, incluindo o próprio rei. Os habitantes do reino tentaram descobrir por que isso aconteceu, mas nunca mais foram vistos. Entre tudo isso, um jovem ladrão chamado Tepeu pretende limpar o reino de todos os poderes das trevas. Seu primeiro objetivo é libertar o outrora poderoso Majin, um gigante mítico. Graças ao dom de Tepeu de conversar com os animais do reino, ele receberá dicas e conselhos úteis em sua jornada.
Majin and The Forsaken Kingdom é, no fundo, um jogo de aventura e quebra-cabeça com elementos de ação. O vasto reino de Q'markaj apresenta inimigos de todos os tamanhos e nem todos requerem força bruta para serem derrotados. O jogador controla Tepeu diretamente e pode, por meio de ordens, comandar o Majin para interagir com o ambiente ou atacar de cabeça nas batalhas. À medida que o jogador avança no jogo, mais poderes podem ser encontrados através das frutas que o jogador deve encontrar e dar ao Majin. Só então ele poderá utilizar esses poderes. No total, são quatro, incluindo energia eólica e relâmpagos. Além do novo conjunto óbvio de habilidades para usar em lutas, esses poderes geralmente fornecem maneiras de superar obstáculos novos ou existentes.
Em última análise o objetivo é chegar até o Rei que se esconde no castelo, porém a porta está protegida por quatro selos. Cada chefe representa um desses selos e ao derrotá-los seus respectivos selos serão quebrados e mais caminhos serão desbloqueados. Mais tarde no jogo, Tepeu e Majin passarão por salas de transporte que rapidamente lhes permitirão cobrir muito terreno e viajar com mais facilidade entre seções específicas do reino.
O jogador muitas vezes pode escolher como abordar certas situações, mas às vezes placas de sinalização e animais podem dar conselhos ou pistas adicionais sobre o que esperar ou pensar em seguida.