Em Pokémon White Version os jogadores podem capturar, treinar e lutar com Pokémons diferentes conforme progridem no jogo, alguns Pokémons podem ser apenas capturados em uma das versões do jogo. Por exemplo, o lendário Pokémon Reshiram pode ser apenas capturado na versão Black enquanto que o lendário Zekrom somente na versão White, pois as duas versões Black e White são uma junção na história.
Além disso, os dois jogos apresentam áreas diferentes pela primeira vez na série, com o mundo do Pokémon Black Version trazendo uma área metropolitana única, chamada Black City, e uma exuberante área verde chamada White Forest encontrada apenas no Pokémon White Version. Alguns Pokémon aparecem somente em determinadas estações do ano, sendo preciso acessar uma estação específica para consegui-los.