O Rei Sapo morreu e Shrek herdou o trono. Como Shrek não é um grande fã dessa ideia, ele e seus amigos viajam para a academia de Worcestershire para recrutar o primo de Fiona, Artie, para o trabalho. Infelizmente, enquanto ele está fora, o covarde Príncipe Encantado tem grandes planos para dominar o reino.
SHReK the THiRD é um jogo de plataforma de ação com forte ênfase em brigas e humor. Com muitos capangas do Príncipe Encantado em seu caminho (incluindo cavaleiros negros, gnomos malignos, um Capitão Gancho sussurrante e árvores ambulantes gigantes), Shrek terá que usar todas as suas habilidades para derrotá-los, encontrar o caminho de casa e pegar alguns canecas de lembrança ao longo do caminho.
Cada nível apresenta várias missões, muitos itens colecionáveis e situações engraçadas. Embora a maioria dos níveis apresente o próprio Shrek, há seis personagens jogáveis no total (Burro, Gato de Botas, Fiona, Artie e Bela Adormecida também), mais de 20 níveis, três grandes batalhas contra chefes e vários minijogos multijogador.