No Império Selecion, o Grão-Ducado de Mais é liderado por Alexis I. Um dia, seu jovem filho Alexis II visita um templo antigo e fica fascinado por uma bela estátua de pedra em seu interior. Dizem que esta estátua é da deusa que protege Mais, mas não existem registros dela e ela nem sequer tem um nome; o jovem Alexis II decide dar-lhe um nome ele mesmo. Não muito tempo depois, a nação monstro de Beaufon avança para o leste em direção a Mais, e na batalha Alexis I perde a vida. No entanto, quando Zaitan, um dos Generais Demônios de Beaufon, se aproxima da capital e tudo parece perdido, uma mulher misteriosa e bela aparece e o derrota com uma força sobre-humana. No entanto, ela não tem memória de seu passado; ela se junta a Alexis e Mais para lutar contra Beaufon e encontrar o significado de sua própria existência, e assim começa uma luta pelo destino do mundo.
Terra Phantastica é um RPG de estratégia tática baseado em turnos no estilo de Tactics Ogre . O jogo principal consiste em sequências de batalha nas quais o jogador e as forças opostas comandam inúmeras unidades em um mapa baseado em grade, movendo-se e atacando inimigos. Cada unidade consiste em um líder e vários soldados, que podem ser organizados em várias formações; soldados podem ser perdidos quando uma unidade é atacada, reduzindo sua eficácia e, eventualmente, eliminando essa unidade da batalha. Os combates entre unidades podem levar vários turnos, com ataques, retiradas, mudanças de formação e outros comandos disponíveis em cada turno. Entre as batalhas, o jogador pode consultar vários outros personagens, bem como organizar, equipar e treinar suas unidades. Múltiplos finais são possíveis dependendo das ações do jogador e do relacionamento do personagem principal com Alexis II.