Hyrule passou a ser protegida por quatro Feras Divinas e por um exército de Guardiões, quando Ganon anuncia seu retorno. Os hyrulianos leram as profecias de seus ancestrais e reconheceram os sinais do retorno de Ganon, escavando e recuperando as Feras Divinas e os Guardiões. Link acorda cem anos depois, porém sem suas memórias e descobre que o povo está em completas ruínas, onde acaba voltando a diversos locais de seu passado para resgatar suas memórias de Zelda.
Em um mundo aberto onde os jogadores podem explorar livremente na pele do herói Link, Breath of the Wild possui um sistema de física que permite que os jogadores abordarem problemas de diferentes maneiras em vez de tentarem encontrar uma solução única. O jogador pode realizar ações como correr, escalar e nadar, porém todas são limitadas pelo fôlego de Link. Ao longo da aventura, o personagem adquire poderes e armas para realizar todas as missões para combater Ganon.