A primeira aventura de Lara no mundo dos dispositivos portáteis envolve a busca pela "Pedra do Pesadelo", que contém uma divindade sinistra. Essa divindade, Quaxet, foi aprisionada pelos esforços combinados das culturas maia, asteca e inca, e agora alguns caçadores de tesouros malvados querem estragar tudo, libertando o mal. Sabendo disso, Lara precisa se preparar para evitar que o desastre aconteça, encontrando a pedra primeiro.
Esta versão tem a jogabilidade padrão de Tomb Raider, com corrida, salto e troca de botões, mas apresentada em um estilo 2D com visão lateral, que lembra Flashback . Lara tem à disposição cerca de 25 movimentos, que estão concentrados nos dois botões do GBC. Há também cristais de salvamento do jogo em pontos especiais ao longo das fases.