É a Era Taishou no Japão, e o mundo ocidental começou a abrir caminho através do Japão tradicional. A tecnologia está evoluindo e o uso do vapor trouxe grandes avanços no transporte de armas. Mas o mundo enfrenta uma ameaça mortal: um culto sombrio deseja destruir o Japão e o próprio mundo. Para combater quaisquer possíveis ameaças, o governo Imperial do Japão reúne 6 jovens de todo o mundo para formar a divisão Hanagumi (Flower Bridage) do Teikoku Kagekidan (Imperial Floral Assault Group). Vestidas com sua orgulhosa armadura espiritual, a Kobou, essas jovens são a linha de frente da defesa contra os adoradores de demônios, mas não têm um líder para guiá-las na batalha.
E, com uma única carta, a vida do jovem alferes da Marinha Ichiro Ogami está prestes a tomar um rumo muito interessante como o líder escolhido do Hanagumi! Ichiro agora precisa ganhar a confiança dos membros do Hanagumi se quiser manter as coisas sob controle.
A jogabilidade de Sakura Taisené uma combinação de aventura no estilo japonês com mecânica de namoro e combate tático baseado em turnos. A maior parte do jogo é gasta explorando o teatro, que serve de disfarce para a base militar. Dependendo das decisões do jogador - para onde ir, qual garota procurar, como responder às perguntas (há um limite de tempo para as respostas) - o protagonista desenvolverá diferentes relacionamentos com as garotas, o que influenciará não apenas os diálogos posteriores e a terminando, mas também afetam ligeiramente seus parâmetros nas batalhas. Durante o combate, o jogador navega com Ichiro e as garotas em um campo de batalha isométrico